中国中医科学院（原名中国中医研究院）成立于1955年，是国家中医药管理局直属的集科研、医疗、教学为一体的综合性中医药研究机构。
下设18个研究所、6家医疗机构、1个研究生院、3家分院和中医古籍出版社、中医杂志社等学术单位；截至2021年底有职工6500余人，拥有王永炎、陈可冀、张伯礼、黄璐琦、仝小林5名院士，路志正、陈可冀、刘志明、薛伯寿、张伯礼、余瀛鳌、翁维良7名国医大师；拥有岐黄工程首席科学家2人，岐黄学者27人，青年岐黄学者4人；拥有荣誉首席研究员11人，首席研究员54人，特聘首席研究员2人。与世界卫生组织（WHO）共同建立了临床研究与信息、针灸、中药三个传统医学合作中心。中国针灸学会、中国中西医结合学会、世界针灸学会联合会均为中国中医科学院挂靠单位。
中医药科学研究是中国中医科学院的中心任务。建院60余年，在中医药基础理论、重大疾病中医药防治及中药新药研发等方面取得了显著成就。截至2021年底，全院共获得院外各级各类科技奖励870余项，其中国家科学技术奖54项。“血瘀证与活血化瘀研究”荣获国家科技进步一等奖；被誉为中药科学研究丰碑的青蒿素及双氢青蒿素研究，荣获国家发明二等奖和全国十大科技成就奖。屠呦呦终身研究员由于在青蒿素发现及其应用于治疗疟疾方面做出的杰出贡献，荣获2015年诺贝尔生理学或医学奖，成为在中国大陆开展科学研究并获得诺贝尔科学奖的第一位中国科学家。继诺奖之后，屠呦呦分别于2016年、2019年荣获国家最高科学技术奖、共和国勋章，成为我院奖励史上的新突破。
拥有部局共建道地药材国家重点实验室培育基地、中药过程控制技术国家工程实验室、中药临床疗效和安全性评价国家工程实验室、国家新药（中药）临床试验研究机构（GCP）、国家中药安全性评价中心（GLP），4个国家中医临床研究基地、14个国家中医药管理局重点研究室、38个国家中医药管理局重点学科、28个国家中医药管理局三级实验室。
中国中医科学院充分发挥中医医疗特色优势，为广大患者提供良好的医疗服务，在抗击重大传染病、抗震救灾等重大公共卫生事件中发挥了积极作用。2020年，组建首批援鄂抗疫国家中医医疗队驰援武汉，整建制接管金银潭医院重症病区，全面参与新冠肺炎救治工作，制定中医药诊疗方案，研发防治新冠肺炎中药新药，彰显了“国家队”的责任和担当。附属西苑医院、广安门医院、望京医院、眼科医院是三级甲等中医医院，另有针灸医院、中医门诊部两家医疗机构。目前，全院开放床位3000余张，年门（急）诊总量700余万人次，出院人数8万人次。2021年西苑医院、广安门医院首批纳入国家发展和改革委员会“辅导类”中医类国家医学中心创建单位。西苑医院、广安门医院和望京医院入选国家区域医疗中心建设输出医院。眼科医院获批筹建全国中医药儿童青少年近视防治中心和全国中医药老年眼病防治中心。全院在肿瘤、心血管、老年病、糖尿病、骨伤科、眼科、血液病、肾病、皮肤病等常见病、多发病、疑难重症的中医及中西医结合治疗方面，具有丰富的经验和独特的疗效，在国内外有较高声誉。目前拥有国家中医心血管病临床医学研究中心，16个国家卫生健康委临床重点专科，43个国家中医药管理局中医重点专科，11个北京市中医重点专科。
中国中医科学院是培养中医药高层次人才的重要基地，为中医药行业培养了大批优秀中医药人才。现有中医学、中药学、中西医结合3个一级学科所涵盖的所有学科专业的博士、硕士学位授予权及图书与情报管理一级学科的硕士学位授予权。2020年开始与上海中医药大学联合招收本博连读屠呦呦中医班，加快探索中医药创新人才培养模式，全力推进中国中医科学院大学建设。有中医学、中药学、中西医结合3个一级学科的博士后科研流动站，2021年底在站博士后研究人员170余人。
图书馆是全国藏书最多的中医药专业图书馆，藏书36万余册，其中珍本、善本、孤本书籍2万余册，是国家古籍重点保护单位、国家级古籍修复中心及全国中医行业古籍保护中心。中国医史博物馆是我国收藏文物最多的中医专业博物馆，收藏文物3000余件。主办和承办18种全国性中医药专业期刊，其中《中国结合医学杂志》、《中医杂志》（英文版）美国国家医学图书馆数据库（MEDLINE）、美国《科学引文索引（扩展库）》（SCI-E）等收录，《中医杂志》2021年荣获第五届中国出版政府奖期刊奖，是唯一的中医药类期刊。
中国中医科学院作为传统医药交流的重要窗口，与美国、德国、挪威、意大利、奥地利5国建立国家级海外中医药中心；在中药资源、康复医疗、糖尿病防治、针灸等领域建立6个国家级国际合作基地；与奥地利、瑞典共建国家“一带一路”联合实验室、国际联合实验室。近年来与30余个“一带一路”倡议国家及地区的科研院所、高等院校等开展医药领域合作，签署110项合作协议；助力国际抗疫，推广中国方案，向国外派遣我国首支国际中医抗疫医疗团队，组织培训研讨会覆盖国家百余个，不断提升中医药国际化进程，为构建人类卫生健康共同体作出积极贡献。
